新一輪審核評估對標國家基本辦學規范和辦學條件規定，在指標體系中設置“紅線”和“底線”要求，體現國家對所有參評學校的剛性約束。
在定性指標中，通過增設對教師、學生出現思想政治、道德品質等負面問題能否及時發現和妥當處置，教材選用工作出現負面問題的處理情況等方面的“負面清單”，關注高校辦學“紅線”。
在定量指標中，通過設置高校思想政治教育、教師隊伍建設、基本辦學條件、學生發展與支持服務方面的要求等“統一必選項”，列出了辦學“底線”標準，其中第一類評估16個，第二類評估17個。
對于突破辦學規范和辦學條件底線等問題突出的高校，教育部和有關省級教育行政部門將采取約談負責人、減少招生計劃、限制新增本科專業備案等問責措施。